产经 来源：经济参考网 2023-06-22 13:52:19
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国际计算生物学学会（ISCB）近日发布消息，计算生物学家、清华大学智能产业研究院卓越访问教授许锦波当选ISCB Fellow，当选理由为通过开创全新计算方式及软件程序，为蛋白质结构预测带来颠覆性变革。
据介绍，ISCB成立于1997年，是计算生物学与生物信息学领域最重要的国际学术组织。ISCB Fellow则是基于学者所做科学贡献的重要性进行遴选，旨在表彰在计算生物学和生物信息学领域做出重大贡献的学者，如2013年诺贝尔化学奖得主迈克尔·莱维特、现代信息论专家李明等。从2009年ISCB开始Fellow评选至今，平均每年当选科学家仅八名。
据了解，许锦波是麻省理工学院博士后，曾任美国芝加哥丰田计算技术研究所终身教授、基因测序巨头Illumina的高级研究员，多次荣获美国斯隆研究奖、美国自然科学基金早期职业奖、国际计算生物学顶级会议RECOMB最佳论文奖和时间检验奖等国际顶级奖项。许锦波2016年提出第一个AI蛋白质折叠算法RaptorX-Contact，首次证明深度学习方法预测蛋白质结构的可行性，实现了AI蛋白质结构预测从0到1的突破。
AI蛋白质结构预测解开了困扰科学家们近60年的难题，对产业意义重大。基于这一技术，靶标蛋白绘制的速度大幅提升，创新药研发迎来新的机遇。合成生物学领域也可以基于这一技术，对催化酶等核心要素进行机理分析，为生物“智”造奠定重要基础。
“AI蛋白质结构预测的价值，在于对蛋白质设计的推动和验证。”许锦波表示，AI蛋白质预测只是一个开始，未来生物科技的颠覆性突破、乃至生物经济的重构，关键在于AI蛋白质设计技术。“运用AI，我们可以根据特定的功能需求设计自然界不存在的蛋白质或改造已有的蛋白质，将为药物研发、高性能材料、环境保护、绿色农业、食品等领域带来革命性的变化。”
2021年，许锦波归国加入清华大学智能产业研究院担任卓越访问教授，并成立AI蛋白质设计平台公司分子之心，意在打通科研与产业壁垒，推动中国自己的AI生命科学发展。许锦波带领团队陆续推出可同时进行侧链预测和蛋白质序列设计的AI算法、首个无需模板的蛋白质配体生成算法、首个端到端的蛋白质柔性对接算法等十余项世界领先的AI算法，相关成果多次在《科学》等顶级学术期刊发表。近期ChatGPT引爆生成式AI浪潮，而许锦波在2019年就使用类似方法开发蛋白质设计算法，并在AI蛋白质生成大模型上逐步突破，用通用性强的底层算法来构建“基础设施”，以期更加精准地满足多元化、个性化的产业级蛋白质生成需求。
为推进AI蛋白质设计技术发展和产业应用，许锦波带领团队推出了业界首个功能完善的AI蛋白质预测、优化、设计平台MoleculeOS，填补了世界范围内尚没有功能完整的AI蛋白质设计和优化平台的空白。这一平台可用“生成”而非“发现”蛋白质的方法，针对药物设计、合成生物学等领域的应用需求，设计具有特定功能的蛋白质产品。
“底层技术的突破将是生物科技产业变革的助燃剂。”许锦波表示，希望能用世界领先的AI蛋白底层技术，助推中国的技术和产业取得竞争优势。
（文章来源：经济参考网）
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